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艾吉泰康助力无创检测HBV整合事件:肝癌预警与乙肝治愈的新路径

2025-12-04 14:42:50

阅读(38)

  研究速览: 重庆医科大学研究团队在 Virologica Sinica 期刊上发表题为Detection of HBV DNA integration in plasma cell-free DNA of different HBV diseases utilizing DNA capture strategy 的研究成果。


  该研究首次系统性地证明,通过特异性乙型肝炎病毒(HBV)探针捕获测序策略,可以高精度、无创地在慢性乙肝(CHB)、肝硬化(LC)乃至肝癌(HCC)患者的血浆游离DNA(cfDNA)中检测到HBV病毒与宿主基因组的整合断点。


  艾吉泰康有幸为该研究设计并合成覆盖HBV多个基因型(A–H)的特异性捕获探针。

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   研究背景:难以逾越的“整合”鸿沟  

  HBV整合入肝细胞基因组是导致慢性乙肝(CHB)进展为肝硬化(LC)和肝细胞癌(HCC)的主要驱动因素之一 。同时,整合后的病毒片段能持续转录表达表面抗原(HBsAg),是抗病毒治疗后难以实现“功能性治愈”(HBsAg持续丢失)的关键障碍。


  然而,传统上对HBV整合的检测主要依赖创伤性的肝组织活检,这极大地限制了其在大规模筛查和长期动态监测中的应用 。因此,开发一种高灵敏度的无创检测方法,以评估病毒整合状态,成为乙肝管理和肝癌早筛领域的迫切需求。


   方法学创新:血液中精准“捕获”病毒踪迹  

  本研究的核心突破在于构建了一套优化的DNA探针捕获联合高通量测序(Capture-NGS)工作流程 ,显著提高了在血浆cfDNA这一低浓度样本中检测病毒整合的准确性和灵敏度。


   严格噪声过滤

  沿用并改进了High-throughput Viral Integration Detection(HIVID)策略,通过优化的生物信息学分析,特别是引入严格的过滤标准(如标准化独特序列支持数(the normalized number of support unique sequences,nnsus,代表整合负荷)≥0.7和独特序列支持数(the number of support unique sequences,nsus)≥3),有效排除了背景噪声,确保了检测的特异性。


  性能验证

  相比传统HIVID方法,优化的策略在人工嵌合DNA样本中展示出更高的准确率(96.8% vs 70.0%)和阳性预测值(PPV 93.3% vs 73.7%)。


  早期整合事件检测能力

  该方法在体外细胞模型(HBV感染的HepG2-NTCP细胞)中,可在感染后第1天即检测到整合事件,显示其适用于检测病毒感染的早期整合过程。


   ▍主要研究发现:整合负荷与肝癌进展相关

  研究团队对25名HBsAg阳性、HBeAg阴性的患者(CHB, LC, HCC)的血浆cfDNA进行了系统分析。


  1、临床适用性与高阳性率


  广泛检出: 成功在25例患者中的22例(88%)血浆cfDNA样本中检测到HBV整合断点。共检测到333个整合断点,证实该方法在临床样本中具有高度可行性。


  2、整合负荷与疾病进展的关联


  HCC负荷显著升高: 肝细胞癌(HCC)患者的nnsus显著高于慢性乙肝(CHB)和肝硬化(LC)患者(P < 0.05)。这提示整合负荷可能是一个有力的生物标志物,反映疾病进展的严重程度。


  3、整合特征与致癌机制


  病毒整合位点: HBV整合断点显著富集于病毒基因组的nt1800附近,支持“双链线性DNA(dslDNA)”是体内整合主要底物的理论。整合断点在人体染色体上呈随机分布,但令人关注的是,超过六成(61.86%)的断点位于基因编码区,提示HBV整合可能通过插入突变影响宿主基因功能。 例如,研究发现了HBV DNA序列插入到肝癌相关基因 KMT2B编码区的案例,可能导致异常表达,驱动肿瘤发生。


  整合机制: 整合发生涉及“非同源末端连接(NHEJ)”和“微同源介导末端连接(MMEJ)”两种主要的DNA修复机制。



   临床启示与未来展望  


  这项研究为 HBV 感染管理和肝癌防治开辟了一条全新的"液体活检"之路。


  1、无创肝癌风险评估


  cfDNA 中 HBV 整合负荷有望成为预测慢性乙肝患者进展为 HCC 的无创预警指标。未来大规模前瞻性研究一旦证实其预后价值,将极大地改变目前的肝癌早筛和监测策略。


  2、抗病毒疗效的监测工具

  由于整合 HBV 是 HBsAg 持续存在的主要原因之一,该方法可作为一种有前景的无创工具,用于动态评估新型抗病毒疗法(如靶向整合 DNA 或 cccDNA 的药物)的实际疗效。


  3、方法学推广价值


  Capture-NGS + 严格生物信息学过滤的策略,为其他病毒(如 HPV、HIV)或病原体与宿主基因组的无创整合研究,提供了可借鉴和推广的技术范式。



  这项研究首次系统地描绘了不同肝病阶段患者血浆 cfDNA 中的 HBV 整合图谱,为实现 HBV 感染的精准、无创监测和肝癌早期干预,迈出了关键而坚实的一步。

  原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1995820X24000828?via%3Dihub


   产品信息  

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  艾吉泰康始终致力于提供全方位、多层次、多场景的 HBV 检测解决方案,以技术创新赋能病原精准捕获。


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  电话:010-89146623/ 18701592757

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来源:艾吉泰康iGeneTech(艾小薇 原创)

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